高性能计算资源开放共享管理办法

高性能计算资源开放共享管理办法（暂行）

一、开放原则

北京协和医院高性能计算集群作为院级公共服务设施，共有180个计算节点，处理器采用Intel Xeon Gold 6336Y，共计8640处理器核，系统的理论浮点峰值计算性能达到800 TFlops，存储总容量达7.2 PB。另外，系统还配置3台4* Tesla A100 GPU节点，及4台2T大内存节点。2023年3月6日起正式开放使用，为用户提供充足的计算资源。

二、计算平台硬件参数

计算节点参数：Intel 6336Y  2.4G 48C /384GB DDR4/960GB SSD/100Gb EDR

GPU节点参数：Intel 6336Y  2.4G 48C /4*NV TESLA A100 40G/1.92TB SSD/100Gb EDR

大内存节点参数：Intel 6336Y  2.4G 48C /2TB DDR4/1.92TB SSD/100Gb EDR

高性能并行存储：60GB/s聚合带宽7.3PBSAS/SATA

用户申请帐号时，请根据实际需求认真填写所需资源，计算资源使用方式分为独占和共享：

独占：用户申请独立节点进行作业，不与其他用户的作业共享节点，避免作业争抢CPU和内存资源的干扰。

共享：用户作业共享计算资源，作业调度系统根据提交作业申请的CPU、内存、GPU资源，以最优的方式分配到集群的计算节点运行。

三、管理规定

1、所有用户必须按照相关的规定使用计算机并提交作业，如发现有不按规定提交作业者，系统管理员有权停止不符合规范的任务，由此产生的额外的机时费，由项目组自行承担，并连续两次违规提交作业并经指导后仍不改正者，管理员有权锁定其账户。

2、出现以下情况时，产生的额外的机时费，由各项目组自行承担：

–用户违规提交作业造成的计算机死机；

–程序有缺陷或对程序估量不足时，耗尽系统资源而造成的计算机

死机；

–用户存储空间耗尽，而导致的程序中断；

3、出现以下情况时，产生的额外的机时费，由管理部门承担：

–意外断电或由于机房环境问题而造成的停机；

–突发性的设备故障而造成的正在运行任务非正常结束。

4、为了防止网络拥塞，建议有超大数据（>5TB）导入的用户请拿硬盘找管理员进行本地导入。

5、实验数据安全提醒：请用户自行保存实验数据，平台不予保存。合同终止6个月后，用户所有数据将被删除。

四、收费标准及收取办法

收费标准待院内网公示后公布并执行。收费管理办法由北京协和医院高性能计算平台管理组负责具体执行。系统运维部按季度统计各项目组使用情况并生成报表，提交项目组确认后执行费用收缴。

五、奖励与优惠办法

1、院内及享受优惠用户在发布其科研成果或发表论文时，应标注“本研究工作得到北京协和医院高性能计算平台支持“，并提交其成果报告或发表论文复印件。平台将根据申报成果，给予用户500-2000个核小时的机时奖励。

2、鼓励用户在国际顶级期刊（如nature、science、cell等）发表论文，并致谢北京协和医院高性能计算平台。如有论文发表，平台下一年度将给予该用户40%的费用优惠（优惠额度最高不超过8万元）。

3、奖励与优惠工作每半年组织一次，由管理组批准执行。

六、上机流程

1、初次接洽

可联系平台技术人员咨询相关事宜，了解平台服务内容，资源情况，使用流程，以及收费政策。

2、开设账号

登录《实验室信息管理系统LIMS》（https://transmedlims.pumch.cn/）-首页-科研服务-生物信息，浏览《高性能计算资源对外开放共享管理办法》，下载并填写《用户上机申请表》《用户安全承诺书》及《科研共享服务合同》，纸质版交到转化楼5038。审核通过后，24h内开通账号。用户上机前应仔细阅读《用户使用手册》，了解用户平台使用方法和注意事项，用户使用过程中，系统管理员为用户提供技术支持，协助用户熟悉平台环境。

备注：《用户上机申请表》《用户安全承诺书》由实际上机人员填写，每人均需填写，另提交申请人身份证正反面复印件。《科研共享服务合同》里课题负责人请填写PI信息，最末表格填写实际上机人员信息，默认该表格中所有用户为同项目组人员，最终经费账单将按项目组发送。

 附件中《用户使用手册》供大家阅读。更多更为详细的课件讲解视屏放置在云盘中，用户可自行下载。https://pan.baidu.com/s/1caWJbtNt7RHl9T5He0JhGA?pwd=x1hb （提取码x1hb）

3、正式上机

用户上机过程中可随时通过运行管理平台（网址待公布）查看作业运行和资源使用情况。根据双方协议，平台部会定期向用户发送资源使用清单，用户应及时支付机时费。上机过程中，平台提供必要的技术支持，包括上机指导、软件安装以及解决运行故障等工作。

4、结束上机

根据双方签署协议/合同规定的时间期限，用户完成预定的上机任务并确认暂无延续项目后，则进入结束上机程序，用户妥善处理各项数据后，账号将暂时封存，若用户再次申请上机并签署协议/合同，则重新启用。院内及其他享受平台优惠的用户有义务定期提交《用户成果报告》。

纸质版材料交到转化楼5038

联系电话：

杨老师 69154531；

王工程师：15201237229